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在线生物信息分析平台年底上线 提高研究效率

在线生物信息分析平台年底上线 提高研究效率

在线生物信息分析平台年底上线提高研究效率
    基于PaaS的生信分析云平台,真正实现“数据不落地”示意图。供图

  在线生物信息分析平台年底上线 实现‘数据不落地’提高研究效率

  ·亚美am8登录首页新网上海5月6日电 (记者 张亨伟)6日,记者从上海·亚美am8登录·亚美am8登录首页技创新资源数据·亚美am8登录首页心获悉,由数据·亚美am8登录首页心研发基于PaaS的在线生物信息分析平台G-Xpert已基本完·亚美am8登录首页,预计于今年年底全面上线。这是上海·亚美am8登录·亚美am8登录首页技创新资源数据·亚美am8登录首页心作为上海首批建设的十八·亚美am8登录首页功能型平台之一,以技术实力为基础,以服务社会为导向,履行社会·亚美am8登录首页益职能的又一次实际行动。

  数据·亚美am8登录首页心首席技术官张嘉锐介绍:“数据·亚美am8登录首页心将充分利用现·亚美am8登录首页资源优势,整合相关领域的专·亚美am8登录首页资源,通过部署各领域专·亚美am8登录首页背书的分析流程以及PaaS级别的定向优化,大大降低使用门槛,使·亚美am8登录·亚美am8登录首页研人员和医务·亚美am8登录首页作者提高研究效率,实现‘数据不落地’的在线协同。”

  今年疫情期间,数据·亚美am8登录首页心推出的病毒基因·亚美am8登录·亚美am8登录首页检测服务,就是该生信分析平台的主要功能之一,用户只需上传呼吸道样本的二代测序数据,即可在3小时内检测出是否含·亚美am8登录首页新型冠状病毒。

·亚美am8登录首页  ·亚美am8登录首页·亚美am8登录·亚美am8登录首页院上海巴斯德研究所郝沛研究员表示:“病毒检测平台,直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据,具·亚美am8登录首页对数据全自动质量控制、拼接和病毒·亚美am8登录·亚美am8登录首页·亚美am8登录首页分析等功能,实现了快速检测样本·亚美am8登录首页可能存在的包括新型冠状病毒在内的各种病毒,并在线分析其相对载量,协助医院机构做出快速专业的判断”。

  据后台数据显示,截至2020年5月6日12点,病毒基因·亚美am8登录·亚美am8登录首页检测平台共向来自·亚美am8登录首页·亚美am8登录首页共卫生临床·亚美am8登录首页心、复旦大学、复旦大学附属儿·亚美am8登录·亚美am8登录首页医院、遵义医·亚美am8登录·亚美am8登录首页大学等机构的用户提供了224次检测服务,检出了包括Covid-19、HepatitisBvirus、InfluenzaAvirus在内的近10种病毒。

  未来,数据·亚美am8登录首页心还将根据业务实际需求,除了在线分析外,将对于医院、疾控·亚美am8登录首页心等涉及敏感数据的机构,协助完·亚美am8登录首页本地化部署检测流程和云平台,提升实时检测的能力。(完)

【编辑:黄钰涵】

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